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在合同纠纷案件中，当事人往往会约定几种不同的合同方式，本文就违约金条款与损害赔偿条款在司法实践中如何适用，作以下分析：
合同法第一百一十四条规定：“当事人可以约定一方违约时应当根据违约情况向对方支付一定数额的违约金，也可以约定因违约产生的损失赔偿额的计算方法。”如果当事人在合同中既约定了违约金条款，又约定了损害赔偿金，对此类合同的法律应如何适用呢
从法理的角度上讲，法律是由于违法行为、违约行为或者由于违反其他的法律规定而应承受的某种不利的法律后果。从产生法律的原因上来分析，大致可以分为三种：一是侵权，也就是违法行为。比如，侵犯他人的财产权利、人身权利、知识产权、或者精神权利而产生的法律。二是违约行为，即违反合同约定，没有履行一定法律关系中的作为或不作为的义务。三是法律规定，一般是指无过错或严格。以上的三种法律是隶属于不同的法律关系，但有时也会隶属于同一个法律关系，而对于不同的法律关系或同一个法律关系有时可能发生法律的竞合。也就是说某种法律事实的出现，有可能导致两种或两种以上的法律的产生，而这些法律之间有可能相互冲突。这就涉及到法律竞合的处理。而对于法律的竞合，一般来说应按重者来处理。
合同法中的违约金具有多种性质，但是最主要的性质是违约赔偿金的性质。如果当事人在合同中既约定了违约金条款，又约定了损害赔偿金，那么违约金的适用就可能与违约损害赔偿的适用发生冲突。
合同法第113条第1款规定：“当事人一方不履行合同义务或者履行合同义务不符合约定，给对方造成损失的，损失赔偿额应当相当于因违约所造成的损失，包括合同履行后可以获得的利益，但不得超过违反合同一方订立合同时预见到或者应当预见到的因违反合同可能造成的损失。”由此可知，违约方赔偿损失也仅以守约方的实际损失为原则，但并不支持惩罚性赔偿。也就是说，违约金与违约损害赔偿是一致的，适用违约金，在没有造成损害的时候，就是惩罚性违约金;在违约行为造成对方损害时，违约金就是赔偿违约金。既然是赔偿违约金，就应当与违约的损失赔偿相结合。结合合同法所确定的原则是：
1.当事人如果在合同中约定了违约金，原则上应当按照约定违约金执行。
2.当事人如果所约定的违约金低于违约方的违约行为所造成的损失的话，非违约方可以请求法院予以增加，因为违约金具有损害赔偿的性质，只要低于所造成的损失，就应当予以弥补。
3.当事人如果约定的违约金过分高于违约行为所造成的损失的，违约方可以请求人民法院适当减少。
在司法实践中，如果当事人在合同中未约定违约金，而当事人仅主张违约金而未主张赔偿的，对其主张一般不应予以支持。合同约定违约金，但是当事人仅主张赔偿损失的，法院应当支持其赔偿损失的请求。
如果当事人既约定违约金，又约定损失赔偿额的计算方法的，且未约定两者排斥适用的，则应当依照当事人的主张选择适用。当事人既主张违约金又要求按照约定的计算方法支付损失赔偿金的，如果计算的损失高于违约金的，且与实际的损失基本相符的，应予支持;如果计算的损失低于违约金的，应当按照约定的违约金确定，但是对方主张约定违约金过分高于损失的除外。
由以上的分析可知，违约金与损害赔偿是不能并用的，其中违约金应当优先适用，而其适用又以能够弥补损失为原则，而不能够从中获取额外的利益。
第三百三十四条研究开发人违反约定造成研究开发工作停滞、延误或者失败的，应当承担违约。
研究开发人违反约定，造成研究开发工作停滞、延误或者失败的，应当承担违约。这是对研究开发人违反委托开发合同应当承担的一般规定。具体讲：
研究开发人未按计划实施研究开发工作的，委托人有权要求其实施研究开发计划并采取补救措施。研究开发人逾期不实施研究开发计划的，委托人有权解除合同。研究开发人应当返还研究开发经费，赔偿因此给委托人造成的损失。
研究开发人将研究开发经费用于履行合同以外的目的的，委托人有权制止并要求其退还相应的经费用于研究开发工作。因此造成研究开发工作停滞、延误或者失败的，研究开发人应当支付违约金或者赔偿损失。经委托人催告后，研究开发人逾期未退还经费用于研究开发工作的，委托人有权解除合同。研究开发人应当返还研究开发经费，赔偿因此给委托人造成的损失。
由于研究开发人的过错，造成研究开发成果不符合合同约定条件的，研究开发人应当支付违约金或者赔偿损失;造成研究开发工作失败的，研究开发人应当返还部分或者全部研究开发经费，支付违约金或者赔偿损失。
